Регулярное выражение в .BAT, как правильно написать?

Никак. CMD не поддерживает регулярки

Отчасти Армянское Радио прав: вы не сможете использовать ваше регулярное выражение в cmd скриптах.
Выхода 2:
1. переписать регулярку на использование средств командной строки
например findstr или for
Однако с группами в findstr я вот не умею работать и даже не представляю, умеет ли он группы
for /f группы умеет, но ограниченно и поддерживать два вида регулярок вам оно надо?
2. использовать powershell
https://docs.microsoft.com/en-us/powershell/module...
Опять таки не гарантирую, что ваша регулярка подойдет без переделок (а еще не гарантирую что в вашей версии posh будет такое же поведение как в описанном документе)

Добавлю свои 5 копеек к ответам:
Текст вашей регулярки содержит спец символы cmd, которые надо экранировать.
Спец. символы в вашем случае это символы: ^()
Экранируются с помощью символа ^
Этим набором спец. символы cmd не исчерпываются и экранирование не всегда такое как в этом случае.