Опубликуют ли коробочное решение App store и Play market?

В маркете нельзя опубликовать два приложения с одинаковым Package name, соответственно, вам нужно будет позаботится о том, чтобы ваши покупатели могли его поменять в исходниках, и сбилдить свой вариант приложения со своей подписью.
И еще, существует риск, что Гугл заблокирует аккаунт одного из клиентов, или ваш, в будущем, за какое нибудь, любое нарушение. А остальные аккаунты засветит как "связанные" (алгоритм определения связанных аккаунтов не известен) и тоже заблокирует. Со всеми вытекающими последствиями.