Каким образом подавать входные данные в нейросеть?

16 битный звуковой сигнал не годится для подачи на вход НС. Его необходимо перевести в АЧХ и еще побить на некоторые атомарные отсчеты наподобие звуков или букв или музыкальных нот. Как побить - это тема отдельного топика и ее надо изучать отдельно. В вашем случае - нельзя рассматривать нейро-сеть как мясорубку куда кидают что ни попадя. Информация должна быть дискретной и осмысленной. Тоесть если вы обучаете НС с учителем то вы должны предъявить сети на вход частотную характеристику ноты ДО первой октавы например и в качестве обучающего сигнала и дать подсказку что это есть нота ДО. Если будете подавать на вход белый шум - то сеть ничему не научится.