Можно ли создать скрипт, для автоматической настройки сервера linux?

Можно

https://github.com/oneinstack/lnmp
https://github.com/centminmod/centminmod

К вышенаписанному хочется добавить cloud-init
офигеннейшая вещь

да это обычный баш скрипт
https://klondike-studio.ru/blog/bekap-saytaov-na-f...
вот например посложнее
https://github.com/servisys/ispconfig_setup/blob/m...

есть так же уже GIT аналоги если у вас прям все сложно
Вы должны понять что в линуксе консольные команды это приоритет и они всегда умеют больше чем GUI
А настройки и конфиги лежат в обычных файлов ( риестр для этого в линуксе не ипользуется)
как следствие легкостью работы с установкой и конфигурациями, зачастую просто достаточно положить ваш конфиг и все настроено.