Как заставить RSYNC копировать все файлы и папки?

man rsync
до понимания. Там все написано

Слэш уберите в пути к источнику.

man rsync гласит:

A trailing slash on the source changes this behavior to avoid creating an additional directory level at the destination.

Т.е. нужно убрать слэш в пути, чтобы создавались подкаталоги.
Там же написано, что, например, эти команды скопируют одно и то же:

rsync -av /src/foo /dest
rsync -av /src/foo/ /dest/foo

Есть слэш - не создаются подкаталоги, нет слэша - создаются.