Почему через скайп слышно музыку?

Один раз было обратное. Человек говорил в микрофон и слышал сам себя. Оказалось, в диспетчере realtek в панели управления стояла галочка выводить звук с микрофона на динамики. Вроде просто, но провозился долго, пока случайно ее не увидел :)
Может у вас аналогичный случай.

Возможно у него громкие наушники и чувствительный микрофон.

Звук с микрофона идёт туда, где всё смешивается и выходит на динамики. А скайп берёт звук не напрямую с микрофона, а как раз из этого места, где всё смешивается.
Дурацкий ответ с плохой терминологией, но я верю что вы поймёте. Вы ещё при этом должны слышать звуковые уведомления других приложений.