Какие есть способа хранения информации offline в php(js)?

shared_memory
redis,memcache & etc

Отправить пользователю на емейл!

Опционально - отправить СЕБЕ на емейл, а по окончании работы скрипта слазить туда через IMAP и загрузить данные из письма обратно. А письмо удалить.

Заодно, может, антивирусом проверят: нет ли среди сериализованных данных вирусов, куков и спамов? не притаилась ли в названиях переменных детская порнография и экстремизм?

Удобно же.

Можно печатать и подшивать в папочку "оффлайн данные скрипта".

Ещё кстати можно запоминать вывод скрипта, но это уже на любителя. Да и память должна быть хорошая, не нонейм.

Та хоть в твиттер постить.
Данные можно хранить, а можно не хранить. Множество мест, где и как данные можно хранить слишком велико.