В какой программе удобнее всего рисовать схему БД?

Free: mysql workbench

Online: dbdsgnr

dbForge Studio for SQL Server

https://www.draw.io/

www.dbschema.com - годная. стоит недорого.

Ну если задача просто рисовать, то старый добрый ErWin))
А вообще очень советую ознакомиться с продуктом Sybase Power Designer - мощный инструмент и визуализатор и программирование, причем даже из существующей БД. Поддерживает довольно много СУБД.

А чем не устраивают возможности самой Management Studio?

На сегодняшний день мне больше всего нравится ERBuilder средство моделирования данных. он очень прост в использовании, вы можете освоить его менее чем за 5 минут благодаря интуитивно понятному интерфейсу. Он поддерживает несколько СУБД, включая MS SQL Server. Существует бесплатная версия инструмента, в противном случае вы можете работать с коммерческой версией в течение пробного периода (я думаю, 15 дней).