VPS. C чего начать?

Так же, как и реальным сервером. Через консоль, хотя можно поставить и панельку.
Основные команды: wiki.fornex.com/index.php/%D0%9A%D0%BE%D0%BC%D0%B0%D0%BD%D0%B4%D1%8B_Linux
А так я бы советовал прикупить книжку по Linux/BSD (в зависимости от нужной ОС) и изучать ее, параллельно ковыряя сервер

Помучаться с консолью Вам придётся только один раз, при установке ISPManager или другой панели, установщик поставит все сервера и нужные демоны, а дальше, всё как Вы и привыкли — удобный веб-интерфейс.
Да и ставить панель очень легко, достаточно wget'нуть один скрипт и запустить его, т.е. нужно только три команды вбить) Не знаю как у других панелей…

Ну читать тут, предположительно не мало, поэтому более простой вариант — заказать необходимую настройку при покупке сервера. Там админки ваши настроят и все, что душе угодно. Ценник за настройку — мизерный. Получайте доступы и работайте.

Многое можно сделать уже готовыми скриптами.
Посмотрите тут — www.webhostingtalk.com/forumdisplay.php?f=108

Есть замечательная вещь для настройки серверов и vps'ов — Webmin. И к тому же OpenSource.
Во многом упростит настройку, даже, если использовать для единовременного конфига.

Панельки на VPS тоже работают.

Мой совет — закажите установку установку и настройку VPS и панельки. Включите ежедневный backup. И начните работать с ним через панельки. А дальше читать по администрированию unix-ов и когда потребуется что-то посмотреть — делаем привычные движения в панельках и смотрим конфиги. Если хочется что-то осмысленное попробовать — пробуем, если что откатываем VPS на вчерашний backup.

В принципе через пару месяцев активного шевеления можно получить level-up до админа-середнячка.

admin.com

А еще можно потренироваться на матрешках — поставить какую-нибудь виртуальную машину и Ubuntu (или другой дистрибутив) и посмотреть, что и как там настраивается.

Рекомендую настроить использование памяти.
Кажется называется стек памяти.
Существенно сэкономите ресурсы.