Алексей

SublimeREPL даже если удасться её завести довольно неудобная штука. Гораздо лучше работает встраивание консоли и запуск REPL в ней. Я использую Terminus и SendCode. Например такая команда поднимает Figwheel и открывает его в собственной вьюшке:

{
        "caption": "Terminus: Run Figwheel.main",
        "command": "terminus_open",
        "args"   : {
            "cmd": ["lein", "fig:dev"],
            "cwd": "${project_path}/../",
            "config_name": "Default",
            "panel_name": "fig:dev"
        }
    }

В самом просто случае
"cmd": ["lein", "repl"]
должно работать.

Также я бы советовал настроить rebel-readline - он гораздо удобнее стандартного (мотивационное видео).