Это действительно может быть багом железки (кармана). У меня есть такой один, при использовании в Ubuntu примерно 14.04 и младше при отмонтировании файловой системы каким-то хером портилось первые пару гигабайт (!) в результате чего терялись не то что файлы, а и таблица разделов с этими самыми разделами. А с более поздними не терялось ничего лишь при использовании NTFS :)
Чтобы проверить что файлы действительно успешно записались на внешний диск, нужно этот диск отключить (безопасным отключением) и подключить снова, так как без отмонтирования вы будете сверяться с кэшем в памяти, а не с реально записанными данными.
Если проблема будет наблюдаться, поинтересуйтесь у производителя насчёт обновления мозгов железки.