HoHsi

[2] вообще не относится к регулярке. Это выбор элемента массива. Так как match в JS (да и во всех реализациях) возвращает массив, то вы просто выбираете 3-ий элемент. Т.е:
/^\/([a-z]*\/[a-z].*?\/[a-z].*?)-(.*).*/

Что у вас там лежит известно только вам.
Но сейчас вы пытаетесь взять второй 3-ий элемент от Null

Решение весьма простое:
К gulp.src дописывается база
CoffeeScript

gulp.src "./path/to/coffee/or/any/*.coffee", { base: './' }
    .pipe gulp.dest "./js/"

В таком случае все зарендарится
в ./js/path/to/coffee/or/any/*.js