АртемЪ

С чем может быть проблема?

Вероятно с тем что это виртуалка.
Дисковая подсистема в виртуалках страдает больше всего. Тут от системы виртуализации зависит, и от кучи других вещей.
От тупо нехватки ресурсов, до неоптимального доступа к ресурсам.
Тут может быть и нехватка памяти для кэширования дисковых операций, и сильная загрузка физического диска, и нехватка процессора, и неоптимальные размеры кластеров и настройки ФС в виртуалке и на хосте.

сервер с установленным ESXi и развёрнутым Windows Server 2019 Datacenter. Стоят такие роли как AD DS, DNS, DHCP, NAT (маршрутизация).

Ну если сказать без использования матершинных слов - не самое удачное сочетание....

Возможно ли как-то физически перенести часть файлов на другой диск, но при этом, чтобы юзеры не видели разницы и для них бы это выглядело ровно точно так же, как до правок?

Конечно.
И вариантом множество.

• Можно банально подмонтировать диск как директорию.
  
• Можно расширить диск на другой диск (динамические диски)
  
• Можно перенести шару на другой компьютер с тем же именем.
  

Ну и далее по списку, лень перечислять.

Какие распределенные файловые системы или хранилища сейчас популярны?

Популярны многие, а вот какие подойдут под конкретную задачу - неизвестно, поскольку неизвестны требования.

Быстро и без забот - S3
Если на своем можно готовые решения вроде Ceph
Если не устраивает функциональность готовых решений - можно делать с нуля.

Выбирается то что наиболее удобно и подходит под задачу.

Существует ли документ, рекомендующий замену оборудования после 3/5 лет использования?

Нет, только внутренние нормативы организации если там такое прописано.

Есть ли в природе то ли рекомендации, то ли прямые документы от, примером, HP или DELL, что оборудование лучше заменить раз в 3/5 лет?

Нет конечно.
Зачем менять оборудование если оно справляется с задачами?
А если не справляется, можно и через полгода менять.

желательно штатовские, они будут иметь больший "вес"

А если штатовские инструкции посоветуют вам утопиться - утопитесь? Поражает идиотизм людей преклоняющихся перед "штатовским". По факту - большая часть штатовского - пьяный бред идиотов.

Вероятно дело в настройках сети и фаервола.
Проверьте доступен ли сервер вообще, есть ли в файерволе разрешающие правила.

чтобы директория User полностью была одинаковой у пользователя

Поместить всех в одну виртуальную локальную сеть и настроить перемещаемые профили.

И в тоже время доступ к файлам был быстрый.

Обеспечить быстрый канал связи между точками.

Почему Linux предпочтительнее для администрирования и чем?

Кто вам такое сказал?
Linux не лучше и не хуже, там просто по другому.

Почему многие предпочитают её?

Почему некоторые предприятия многие предприятия предпочитают покупать экскаваторы вместо автобусов? Ответ простой - экскаватором гораздо удобнее копать траншеи чем автобусом.
По этой же причине предпочитают и линукс.

Есть ли смысл обращаться в Полицию

Нет.
Серьезного ущерба нет - какой смысл полиции заниматься этим делом? Они вам посоветуют дурью не маяться, а настраивать безопасность на серверах нормально.
Заявление конечно примут, если будете настаивать, но толку от этого никакого не будет.

Никогда никому пароль из ЛК Провейдера А, который хранится там в открытом виде, я не говорил и ни в каких переписках никогда не скидывал

Пароль не может хранится в ЛК провайдера в открытом виде!
Так делают только при регистрации сервиса - вам скидывают адреса доступа и пароль и напоминают что его нужно обязательно поменять.
Вы этот пароль должны моментально поменять на свой, который нигде не будет храниться. Если вы этого не сделали - ну ловите проблемы.

Можно и если да, то как именно, ограничить трафик на определённый порт(ы)?

Это может сделать провайдер или стононний сервис за приличную оплату.
Провайдеры обычно таким не занимаются - им проще отключить проблемного абонента.

Ну например у меня канал 400/40, я бы мог выделить 200/20 под сайт, а остальное для домашней сети

При DDOS ляжет канал от провайдера к вам, и доступа в интернет не будет.
А внутри своей локальной сети вы можете делить что угодно.

Почему бэкап не работает в виртуал боксе и в vmware и даже в huper - v?

Потому что другое железо.
Шансы на то, что он загрузиться без проблем примерно такие же как попадание метеорита в ваш дом.

Переносите на точно такое же железо - тогда проще запустить будет, меньше проблем.
Если же хотите запустить в vmware и даже в huper - v то придется решить кучу проблем. Настроить соответствующим образом виртуальную машину, подготовить виртуальный диск - сбросить на стандартные все драйвера, тип процессора, интерфейсы, и.т.п, интегрировать в систему нужные драйвера, настроить загрузку, и после чего аккуратно пытаться стартовать отслеживая ошибки и решая вылезающие проблемы.

В свежих системах немного проще, они уже подготовлены к запуску на VM, но и там в любом случае нет гарантии что заработает без настроек на другом железе.

На деле - в настройках MEBx, нет опции чтобы его включить.

Он там не включается, а настраивается. Если настроили все правильно и есть поддержка на уровне железа, должно работать.

Для начала проверьте поддержку -
на матплате она есть, раз доступен MEBx
на процессоре - смотрите по модели установленного процессора. или назовите модель процессора.

Как правильно активировать Windows server 2012 Standart r2?

Да как угодно.

ипо у некоторых после левой активации комп начал глючить и тд.

чушь.

можно ли активировать windows server 2012 standart r2 с помощью KMSAuto Lite?

Вполне.

Подумали и об приобретении лицензии.. нашел 2 шт в ебай

откуда там возьмутся лицензии? Ключики активации там можно купить без проблем.

Ни разу не покупал лицензию, по этому обращаюсь к вам..

А зря, обращатся по этому поводу надо в офисы продаж майкрософт или их официальных представителей. Они вам подберут лицензию.

Подключение к RDP без входа конкретного пользователя

Никак.
Подключение RDP это подключение конкретного пользователя.

В сети есть мнение, что файл подкачки негативно влияет на твердотельные накопители.

Совершенно верно, такие мнения в сети есть.

файл подкачки негативно влияет на твердотельные накопители

Чушь полнейшая, от неграмотных идиотов.

Действительно ли это так и стоит ли настраиваться swap на VPS с SSD?

Да, это так, да стоит делать свап на SSD.

Отдельно хочется сказать про VPS - когда вы работаете с VPS, то стоит понимать что SSD это не более чем маркетинговый ход. Вы работаете не с диском, а с виртуальным дисковым пространством. А на чем оно размещается физически вам вообще фиолетово.