Современные диски, особенно ноутбучные имеют агрессивные настройки управления вращения шпинделя, и как правило после примерно 30 секунд бездействия гасят шпиндель, особенно этим отличаются WD. Скорее всего это и есть ваши щелчки. А по сути вопроса, если дисковая утилита не нашла ошибок, то скорее всего все хорошо.