1) Компиль из под среды.
2) Если хочешь из КС, то команда javaс у тебя не работает. Тебе об этом даже на русском написали.
3) В Tomcat ты только запускаешь сервлет, а не компилируешь. Здесь ты используешь библиотеку Кота для компиляции своего класса.