Какой то некорректный вопрос.

Администрируют что-то. С какого компьютера ты это будешь делать - фиалетово. Так же как фиалетово то, какая ОС там будет стоять. Вопрос больше удобства и личных предпочтений. Это может быть даже не компьютер, а планшет или даже телефон.

А вот какая ОС будет стоять на сервере, который ты админишь - навряд ли это то, что ты сможешь выбирать. Что подсунут, то и будешь админить. Даже если дадут выбор, он будет нередко обусловлен ограничениями инструмента, который ты на этот сервер будешь ставить. Например Active Directory ты наврядли будешь поднимать на линуксе, так же как в былые времена сервера 1С на линукс попросту не существовало. Сетевые шлюзы, вебсервера, сервера БД, гипервизоры наверняка будут крутиться на Линуксе.

Да, есть такой момент, что из-за лучшей интеграции некоторых вещей Linux удобнее админить с Linux, а Windows с Windows. Но не всегда это критичные моменты.

Так что вопрос больше стоит - что ты будешь админить. И вот в этом плане я бы отдал предпочтение Linux - это гораздо более гибкая система, с богатейшими возможностями автоматизации всего и вся, с интересными задачами, через продолжительный период администрирования в нем ты получишь бесценный багаж знаний и понимания в самых разных сферах.