Это похоже на экструзию.
То есть, рисуется 2Д фигура и выдавливается до нужной толщины.
В вашем случае нарисован квадрат перечислением 2Д координат его вершин (x, y):
<segments>
<line>0.000, 0.000</line>
<line>0.000, 0.001</line>
<line>0.001, 0.001</line>
<line>0.001, 0.000</line>
</segments>
И этому квадрату задана толщина (высота в 3Д):
<shape thickness="0.018">
И в конечном итоге всё это оттрансформированно матрицей преобразования:
<matrix>
0.000000000000003, 0.000000000000005, -0.055555555555555, -1.999500000000000,
0.000000000000000, -1.000000000000000, 0.000000000000000, -1.498750000000000,
-1.000000000000000, 0.000000000000000, 0.000000000000000, -1.998750000000000,
0.000000000000000, 0.000000000000000, 0.000000000000000, 1.000000000000000
</matrix>
Тут, если посмотреть внимательнее, правая колонка - сдвиг, а по диагонали - масштаб каждой из осей. Но в общем случае там ещё может быть и поворот.