Включите интеграцию в настройках. Должны подтянуться. Но не факт.
У ms2Gallery свой источник файлов со своими настройками. Посмотрите документацию, там была загрузка через API.
Да ничего вы там особо не примените. Если брать Minishop2, то там вполне оптимально всё сделано изначально. Остальное настраивается на стороне сервера.
Вообще Modx не особо подходит под большие и сложные проекты. Не для этого задумывался.