Алексей

Зависеть может от чего угодно и в том числе суммарно.
Даже от того, какой и сколько модулей активировано и как настроены на сайте и заканчивая всякими побочными настройками - СУБД MySQL, какого типа таблицы, какая версия PHP, и т.д. и т.п.
Короче однозначного ответа нет.
Больше 1 с многовато. Но это уже отданная страница? Или время генерации на сервере?
Впрочем для Wordpress, подумал я тут, это вполне нормальная ситуация.

Для работы приложения на node.js нужна собственно среда node.js на сервере, без нее код не будет работать никак.
Практически всегда веб-приложение на node.js уже запускает свой вебсервер, это действительно хороший вариант и производительный. Никаких прослоек, обычно не требуется. Иногда поверх пускают nginx, так как он лучше справляется с отдачей статики (например css, js и картинок).
В вашем случае, так как порт для сайтов уже занят Apache, то вам достаточно создать в нем вхост, где сделать прокси на порт, на котором будет работать ваше приложение на node.js. При этом напрямую доступа Apache к папке с файлами приложения иметь не обязательно (да и не нужно, лишняя дырка).
В идеале конечно следует избавиться от Apache в пользу nginx. Так как Apache будет создавать узкое горлышко для производительности приложения на node.js