Это не браузер ждёт ответа, а сервер не отвечает.
Скрипт к которому ты обращаешься с помощью AJAX блокирует сессию до завершения своей работы.
Вот решение твоей проблемы.
konrness.com/php5/how-to-prevent-blocking-php-requests
epsiloncool.ru/programmirovanie/php/zavisanie-skri...