Написать свой обмен данными с 1С - это если сохранение позиций в поисковой выдаче приоритетно. Для всех заведённых товаров в битриксе проставляете артикулы(или uid'ы) из 1С. Пишите простецкий скрипт, размещаете его по адресу, например
https://site.ru/import.php, на который из 1С раз в час приходит json или xml файл с ценами и остатками. Так вы гарантированно сохраните текущие url'ы.