если коротко то стоимость программы становится в 2.5х больше.
Развернуто из винды ни кто не тащит программы в линукс, слишком маленькая аудитория, а вот обратный ход возможен.
UI делают на QT
сетевой стек Npcap WinPcap
Впрочем делают часто для галочки да и не все возможно перенести.
Типичный пример это NGINX, Apache
В общем старайтесь избегать кросплатформенных приложений, особенно на таком низком уровне.
Кросплатформенность хороша только в Java и NET и то с той оговоркой что пишите только серверные приложения.