Нет, keepalived не будет работать в разных ЦОД. Но есть исключение - если сделаете L2VPN или типа того.
Рассмотрите более продвинутые варианты обеспечения отказоустойчивости (вроде BGP анонсов, либо закройтесь внешним прокси вроде Qrator/cloudflare). И ОБЯЗАТЕЛЬНО ПРОКОНСУЛЬТИРУЙТЕСЬ с сотрудниками ЦОД - они наверняка хорошо знают свою инфраструктуру и могут предложить варианты (например, плавающий между ЦОДами IP адрес, если ЦОДы принадлежат одному владельцу)
