На шареде намного больше ресурсов на пользователя выделено. Другой вопрос, что shared он на то и shared, что ресурсов в определенный момент времени может и не достаться.
запускать lamp-стек на 256 мегабайтах бесполезно. Тем более, с ispmanager - наверняка там позапускали всё нужное и ненужное. 4ка начинала работать на 768mb ram, 5ка еле шевелится, если меньше гигабайта.