newpy

Не пробовал "кастить" VARBINARY -> CHAR на уровне базы?

SELECT CAST(binaryColumn as CHAR) from table_name

оформлю уже тогда вместо комментариев =)
много библиотек, но из последнего для работы с БД мне понравилась

1. records, её автор Kenneth Reitz автор библиотеки requests.

2. peewee вторая вполне известная небольшая и чем-то похожая на django ORM или Alchemy

проверить в .env DB_HOST заменить на 127.0.0.1, возможно mysql создает сокет в /var/run/mysql/mysql.sock
php.ini тогда так:
mysql.default_socket = /var/run/mysqld/mysqld.sock
mysqli.default_socket = /var/run/mysqld/mysqld.sock
pdo_mysql.default_socket = /var/run/mysqld/mysqld.sock

Или как узнать сокет:
$ mysql -uroot -p
mysql> show variables like '%sock%';

покажет путь сокета, останется прописать в php.ini

могу посоветовать еще Люк Веллинг и Лора Томпсон "Разработка веб-приложений с помощью PHP и MySQL". Единственное надо найти последнее издание (скорее всего на текущий момент это 4-е издание). И в книге ввиду года издания 2010, рассматриваются примеры и объясняются на примерах с использованием старых версий PHP и MySQL. Но концептуально это ни на что не влияет. Основополагающие принципы там изложены исключительно понятно, подробно и хорошо. Мне в свое время очень помогла.