pfg21

тут больше подойдет слово герметизация - ибо попадание раствора на металлические части приведет к коррозии и в длительной переспективе к разрушению схемы.

если схема/провода будет контактировать с раствором, то появятся не только взаимонаводки, но и утечки , которые также внесут ошибку в измерения.
залей лаком/герметиком, который точно будет устойчив к твоему раствору.

от взаимонаводок вполне просто избавится просто разнеся датчики на достаточно большое расстояние.

поставить интегратор значения.
в простешем случае резистор + емкость. подобрать/посчитать сопротивление и емкость, чтобы сгладить импульсы значений. получишь среднеарифметическое значение тока.
в пдфке по твоей ссылке есть пример простейшего фильтра.

1. взять высокоточные датчики температуры. Pt к примеру. калбировать не имея калибровочнго "опорного" датчика бессмысленно.
2. да. сначала разослать сигнал запуска измерения температуры, потом опросить. опрос можно делать не торопясь - данные сохраняются в регистре до след.измерения.
3. использовать источник тока. питание отделить от сигнала. попробовать поработаь на максимальной частоте