Иногда SourceTree выдаёт окно авторизации не на передний план и его нужно активировать из панели задач. А до этого процесс клонирования "подвисает" в ожидании данных для авторизации.
Попробуй через консоль склонировать. Если тоже не сработает, то проблемы с Bitbucket.