Если вам плевать на результаты - можете сканировать, применять какие-то скрипты по замене чего-то и так далее. Ни один из этих методов не дает гарантии обнаружения всей заразы. Гарантированный метод избавления - стереть все и накатить заведомо чистые копии, как уже написано выше. Главное чтобы копии были чистые, а не с уже залитыми шеллами :-)