Зная С++ и программируя на той же Java, C# можно представлять более детально, что происходит "под капотом". С/C++ используется сейчас активно для программирования микроконтроллеров, да и даже для ПК если что-то нужно написать "нативное", то альтернативы С++ практически нет.

Если печать корпусов нужна регулярно, не советовал бы связываться с 3D принтером. Был уже опыт у меня. Во-первых - дорого, во-вторых - печать очень медленная (корпус, который помещается на ладонь печатается до 5-ти часов), в-третьих - качество не ахти, если не применять постобработку. 3D принтер подойдет только для прототипирования, чтобы можно было визуально увидеть, как в реале будет выглядеть корпус.

Смотря что имеется ввиду под фразой "Программирование под автомобили". Если стоит задача написать приложение, которое будет взаимодействовать с ЭБУ автомобиля, то копайте в сторону стандарта J2534, который описывает взаимолействие между компьютером и адаптером, который работает уже непосредственно с автомобильными шинами данных. В сети есть примеры, например, вот под C# : https://github.com/mkelly/J2534DotNet
Если нужна именно разработка ПО под сам ЭБУ, то там скорее всего только C придется использовать. Вот пример такой разработки: sourceforge.net/projects/rusefi